南沙区总工会成立于2006年12月，2016年2月增设办公室，无其它内设机构。广州南沙经济技术开发区工会工作委员会成立于2009年7月，是广州市总工会的派出机构，与南沙区总工会实行两个牌子一套人员的工作机构。